An objective comparison of cell-tracking algorithms

• Název česky: Objektivní porovnání algoritmů pro sledování buněk
• Autoři: ULMAN Vladimír; MAŠKA Martin; MAGNUSSON Klas E G; RONNEBERGER Olaf; HAUBOLD Carsten; HARDER Nathalie; MATULA Pavel; MATULA Petr; SVOBODA David; RADOJEVIC Miroslav; SMAL Ihor; ROHR Karl; JALDÉN Joakim; BLAU Helen M; DZYUBACHYK Oleh; LELIEVELDT Boudewijn; XIAO Pengdong; LI Yuexiang; CHO Siu-Yeung; DUFOUR Alexandre C; OLIVO-MARIN Jean-Christophe; REYES-ALDASORO Constantino C; SOLIS-LEMUS Jose A; BENSCH Robert; BROX Thomas; STEGMAIER Johannes; MIKUT Ralf; WOLF Steffen; HAMPRECHT Fred A; ESTEVES Tiago; QUELHAS Pedro; DEMIREL Ömer; MALMSTRÖM Lars; JUG Florian; TOMANCAK Pavel; MEIJERING Erik; MUNOZ-BARRUTIA Arrate; KOZUBEK Michal; ORTIZ-DE-SOLORZANO Carlos
• Rok publikování: 2017
• Druh: Článek v odborném periodiku
• Časopis / Zdroj: Nature Methods
• Fakulta / Pracoviště MU: Fakulta informatiky
• www: URL
• Doi: https://doi.org/10.1038/nmeth.4473
• Obor: Informatika
• Klíčová slova: Cell migration; Image processing
• Popis: Článek prezentuje zprávu zahrnující výsledky tří vydání Cell Tracking Challenge, pokračující iniciativě zaměřené na rozvoj a objektivní porovnávání algoritmů sledování buněk. Článek analyzuje výsledky detekování a sledování buněk pomocí několika výkonnostních metrik a na základě toho vypočítává pořadí hodnocených metod. Článek dále analyzuje výkonnosti těchto algoritmů na základě tzv. biologicky inspirovaných metric a také na základě jejich praktické užitnosti.

Související projekty

• Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu a při diferenciaci v normě a patologii
• Benchmarking algoritmů segmentace a sledování buněk